מוזיאון ישראל הוא המוזיאון הגדול בישראל ואחד מעשרת המוזיאונים הגדולים בעולם. מצויים בו אוספים בתחומי ארכיאולוגיה, אתנוגרפיה, יודאיקה, אמנות ישראלית ואמנות העולם.

אגף האמנות היהודית והיודאיקה במוזיאון כולל כתבי יד עתיקים, שני בתי כנסת על תכולתם, תצוגת לבוש של עדות ישראל השונות, תשמישי קדושה וכלים המוקדשים לחגי ישראל, ציורים ופסלים של אמנים יהודיים.

אגף האמנויות במוזיאון כולל ביתן לאמנות ישראלית, ביתן לאמנות מודרנית, ביתן לעיצוב ואדריכלות, ביתן לצילום, ביתן לאמנות מזרח אסיה וביתן לאמנות אפריקה, אוקיאניה ויבשת אמריקה.

אגף הארכיאולוגיה במוזיאון מציג ממצאים ארכיאולוגיים, עם דגש על הארכיאולוגיה של ארץ ישראל.

בתחומי המוזיאון מצוי גם היכל הספר - משכן לתגליות ארכיאולוגיות יוצאות דופן: מגילות מדבר יהודה ("המגילות הגנוזות") וכתבי יד עתיקים ונדירים של התנ"ך, כגון כתר ארם צובה. במתחם היכל הספר מוצג דגם של ירושלים בסוף ימי הבית השני, המשחזר בקנה מידה של 1:50 את מראה העיר בשנת 66 לספירה, עת הגיעה לשיא גודלה והתפתחותה, רגע לפני פרוץ המרד הגדול ברומאים שהביא לחורבנה.